Uygulamada görülen aksaklıkların giderilmesi amacıyla ve uygulayıcılardan gelen talepler doğrultusunda 14. 3. 2016 tarih 2016/8646 sayılı Bakanlar Kurulu Kararı ile 41 maddeden oluşan Yönetmeliğin toplam 20 maddesinde değişiklik yapılmış.
Yapılan bu değişiklikler Yönetmeliğin genel yapısını değiştirmemekle birlikte, özellikle Taşınır Kayıt Yetkilisinin yaptığı işlemleri Harcama Yetkilisi adına kontrol etmek üzere Taşınır Kontrol Yetkilisi isimli bir görevlinin belirlenmiş olması, sorumluluğun paylaşılmasında yeni bir uygulama getirmiş, bazı yeni tanımlarla birlikte mevcut tanımların kapsamı genişletilmiş, harcama birimleri itibariyle hazırlanan taşınır mal yönetim hesabının Sayıştay'a gönderilmesi yerine, harcama biriminde muhafaza edilmesi ve denetime yetkili olanlarca istenilmesi halinde ibraz edilmesi öngörülmüş, bunlarla birlikte dikkate değer bazı değişiklik ve yenilikler de getirilmiştir.